Vai ser preciso muito mais do que uma caneta e uma bússola para sobreviver a um ano completo de Persona 3. Não só os jogadores têm de enfrentar os desafios do dia a dia da vida em uma escola japonesa, mas há também a questão dos demônios que se refugiam na hora que se encontra escondida entre um dia e o dia seguinte.
Embora parte da série Shin Megami Tensei, Persona 3 é uma entrada independente da série que não exige conhecimento prévio de jogos Shin Megami Tensei e não tem nenhuma conexão com cenários ou personagens anteriores. Situado em uma cidade completamente nova e fictícia, Persona 3 recria uma autêntica escola japonesa até as relações que o jogador pode fazer e quebrar durante todo um ano lectivo.
Durante o dia os jogadores fazem parte de vida enquanto estudantes de uma escola enquanto também melhoram as suas capacidades com as escolhas que fazem durante o dia escolar. Ao passar o tempo sabiamente durante o dia os jogadores vão ter a oportunidade de melhorar suas habilidades em batalha e expandir a variedade de Personas que pode convocar.
Personas entram em jogo durante a noite, quando eles podem ser convocados para lutar contra os demónios e proteger-te de uma morte prematura. Ao crescer o teu relacionamento com colegas também cresce o teu domínio sobre os Personas. Personas diferentes podem ainda ser combinados para produzir até criações mais poderosas que aguardam o teu comando.